Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TO15178 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TO15178 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TO15178 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TO15178 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TO15178 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TO15178 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TO15178 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TO15178 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TO15178 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TO15178 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TO15178 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms