Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP17L11C9JVI0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L11C9JVI0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms