Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TVP23AA6NH52 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms