Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC4A6NH21 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms