Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF6Q9Y4K3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms