Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT52Q9Y366 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms