Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLA2G4CQ9UP65 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms