Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms