Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms