Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABI3Q9P2A4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABI3Q9P2A4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms