Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GOPCQ9HD26 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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