Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms