Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms