Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORT1Q99523 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms