Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF3RQ99062 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF3RQ99062 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms