Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EP400Q96L91 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EP400Q96L91 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms