Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCMH1Q96GD3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms