Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms