Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A6Q92581 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms