Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms