Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC4Q8TBB5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms