Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF439Q8NDP4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF439Q8NDP4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF439Q8NDP4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF439Q8NDP4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF439Q8NDP4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ZNF439Q8NDP4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ZNF439Q8NDP4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms