Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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