Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms