Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms