Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms