Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC149Q6ZUS6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms