Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H3F3CQ6NXT2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms