Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REEP3Q6NUK4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms