Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms