Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF8Q5VWM4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms