Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms