Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms