Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms