Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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