Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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