Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms