Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA6Q15825 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms