Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYTH1Q15438 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYTH1Q15438 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms