Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPRRQ15256 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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