Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A3Q14050 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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