Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKP1Q13835 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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