Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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SHROOM2Q13796 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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SHROOM2Q13796 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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SHROOM2Q13796 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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SHROOM2Q13796 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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SHROOM2Q13796 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHROOM2Q13796 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
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