Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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