Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
UBE2V1Q13404 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms