Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ATMQ13315 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATMQ13315 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms