Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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