Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAA1Q13131 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms