Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GPS1Q13098 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GPS1Q13098 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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