Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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